Con la titolatura di oratorio di Santa Lucia esisteva una chiesa in Perignano vecchio, località Santa Lucia (distinta da Sant'Andrea), oggi inglobata in un casolare ancora esistente a nord di Perignano.
L'edificio è attestato esistente già nel medioevo, quando in Perignano esistevano gli abitati di S. Andrea e di S. Lucia, andati poi spopolandosi in seguito alla politica d'abbandono del territorio pisano perpetrata dai Fiorentini. Quando però, nel XIX secolo fu costruita l'attuale parrocchiale di Perignano, il vecchio oratorio fu sconsacrato e adibito ad altro uso.
Intorno all'oratorio sorgeva il paese di Santa Lucia in Perignano.
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